你發表第一篇英文 SCI 論文經歷了怎樣的過程?

問題描述:大家第一篇SCI論文是怎樣憋出來的...
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Aorqu用戶牛津大學 醫學院博士在讀:
講博二的時候的那篇Nature Comm叭…作者是:我,我老闆*,我老闆*。

課題是pan-cancer analysis,分析的TCGA的數據,課題是老闆A教授某天下午突發奇想,給我一個idea,那時候差不多一年級讀到一半。
然後我就覺得這idea聽起來靠譜啊,然後就開始做了…做了半年,老闆C教授(我的另一個老闆)說,感覺差不多了,你寫篇formal writtenup叭。我就花了兩周寫了,很low的written up,交給老闆,繼續把我的analysis從五種cancer擴大到12種cancer。

過了幾周,C老闆說,他跟學術圈裡的朋友聊過,還很有價值,讓我繼續做。於是我又一遍擴大我的analysis到24種cancers,一邊做我的單細胞測序實驗…

又過了三個月,我發現我們研究的突變居然還跟hypermutation有關系,又經過一兩個月的分析,先做出ppt,每一張是一個主要的figure,幫助理清思路。老闆C幫我大改了一次,我就開始寫manuscript(paper的稿件)。期間,Nature Genetics發表了一篇很類似的文章,我哭了一個晚上。

吐著血寫完first draft,扔給老闆C和老闆A。老闆A一看,嘿,好傢夥,不錯嘛。然後我們就開始改文章。最開始一個月,每隔3-5天去老闆A辦公室討論改1-2小時文章,然後拿回來改,補anslysis,再交回去。到了後期,基本1-2天就meet一次改文章,有連著幾周,周六也去和老闆A meet。真的是超高強度…∠( ᐛ 」∠)_

終於到聖誕節前,我們要submit了!submit Nature Genetics被desk rejection秒拒,然後轉去了Nature Comm…

一審是漫長的3個月…審稿人意見返回時,其實比較positive,從NC的回信模版都可以看出,有被接受的希望。我們花了三周時間寫rebuttal,其實也沒有什麼分析要補…然後發回去,然後又是漫長的2.5個月…這一次差不多惹,還有幾個小問題。再寫rebuttal,三審,過了!再就是proof,等著online…

中間壓力有多大,有多焦慮,我就不細說了…
(⊙v⊙)投過的人都知道。

反正又要開始寫文章了。fingers acrossed。


匿名用戶:

我第一篇SCI論文就在Science上,當然,那隻是掛名

我猜提主的意思是,第一作者的SCI…

我比較曲折,導師是畫餅派,偶爾小push,但是主旋律是畫餅

其實他畫的餅,我都是信的,只是操作上,有點困難…

那還是遙遠的6年前,我自己主打做實驗了,心裡是很慌的;

我要求很低,搞夠3篇SCI畢業;

然後老師說,這個XXX有意思、非常有意義、很有趣;

看他這興致,那不是Science也應該是Nature Chemistry了吧;

我滴個神,那還不趕緊走起;

連續三個月,我每個周一進實驗室,周五離開實驗室,連續通宵,周末準備下一次實驗;

雖然是很累,但是我完全感覺不到;

之後又花了兩個月,好好處理數據,一手的好分析;

然後…然後…我們等等理論計算吧,理論分析的好的話,應該不錯~

6年過去了…理論還在嗝屁

第一個半年過去了,不灰心,我們再戰;

這一次戰線更長,幾乎是不可能完成的任務,

但是做出來,絕對是Science

幸運的是,我花了兩年做出來了!

但是我當時的心態,不需要別人給我畫餅了,我還能給別人畫餅,

我問我寢室的小夥伴:

「你,你知道有啥比Science更好的雜志么;我這個發Science虧了啊,Science上那麼多那麼水的文章;我這個至少是愛因斯坦級別的啊…」

這次我不要理論了,要個錘子的理論,我純實驗已經遠超Science了好么…

文章弄好了給老師,投,趕緊的…

老師猶豫了一秒鐘:

“這個工作挺好的,投Science還是太單薄了點,我們投J. Phys. Chem. Lett.吧,JPCL也是很好的雜志喲「

嗯,對的,我的第一篇SCI就是J. Phys. Chem. Lett.

其實畫餅挺好的,

那動力,杠杠滴!


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Aorqu用戶:

我這個挺曲折……基本把能踩的坑全踩了一遍。一篇文章搞了一年多。

一開始數據搞得差不多了以後,開始寫初稿。第一次寫嘛,文字,排版,數據描述和分析,作圖,全都是問題。不過還好實驗室里的博後夠耐心,我這一點一點磨著,也算是勉強把框架弄出來了。搞完以後開始改語言,來來回回修了十遍左右,初稿基本完成。大概從開始寫到初稿,接近一個月吧。然後開始投稿。

然而坑爹的事在後頭。

最先投的是ACS旗下某非常不錯的刊物A。投出去以後說創新性不夠,建議轉投ACS旗下刊物B。

B期刊其實挺不錯的,我一開始的期望值也根本沒有去投A的打算,能建議轉投B,我覺得已經心滿意足了,果斷轉投。

然而過了沒兩天,老闆跑來找我,說準備投下一個期刊,那篇文章已經分配好編輯了,那個編輯對他有意見的,不會讓我們的文章過,準備投下個期刊吧……忘記了當天還是第二天,文章被拒。順便說一下我們組投了三篇去期刊B,不知道為啥總能到那個編輯手裡,然後三篇都脆拒……

[踩坑1:文章到了對老闆有敵意的編輯手裡。]

實話說被A和B拒我覺得沒什麼的,畢竟都屬於業內很不錯的期刊了,只不過覺得遺憾,拖了這么長時間卻沒有得到任何有價值的參考意見。在被兩個期刊拒了以後,老闆讓我去投Wiley旗下某不錯的期刊C。

投C的時候送審了。然後審稿人回復意見,其中一個對我們計算材料性能的方式提出了質疑(問我們用什麼方法算),並且認為我們有的細節沒有給出,要求補充內容,並且認為我們這個文章創新性不夠,直接拒掉並建議轉投一個影響因子比較低的期刊。

然而審稿人有兩位,另一位審稿人意見表示建議轉投另一個也挺不錯的期刊D,於是我們改了下文章,就自行投了D。

期刊D的編輯表示看到了其他兩位審稿人的意見,讓我直接回答投期刊C的時候審稿人問的問題。然而之前那個質疑我們的審稿人在問的時候對我們的回答不滿意,並且堅持認為創新性不夠,然後堅持讓我轉投那個低影響因子的期刊。

[踩坑2:回答審稿人意見的時候不夠仔細。後來感覺是,當他問你你用的A法還是B法的時候,不要只回答A法還是B法,最好可以找到充分的選擇A法或者B法的理由去回答,不要只給他一個答案。]

一路被拒其實我也沒啥信心了,然後說要不投ACS旗下的期刊E吧。其實我覺得E應該差不多中了吧,畢竟前面有送審經歷,然而期刊E其實比ABCD都差。感覺這次該可以了吧?

後來審稿意見回來,還是拒……而且審稿人把我們的文章噴了一通,說哪裡哪裡有問題。

一開始其實我是失望加生氣的,不僅僅因為我文章被拒了,而且因為審稿人回復意見的用詞實在是非常無理。然而後來我覺得審稿人給提的意見真是漂亮,這是我學習到最多東西的審稿意見。其實這次拒稿拒得我特別高興,我印象特別深的是,我洗澡的時候想到審稿人給我的意見里列出了一堆文獻,讓我學習到了很多東西,我一個人就對著個噴頭傻笑,笑出來了……這個經歷以前有提到過:

Aorqu用戶:第一篇論文多次被拒稿是什麼體驗?

那個招人討厭的審稿人其中給的一篇文章,是一篇發在Chemistry of Materials上的文章,講解了我這個領域應該做的完整的表徵流程。這個很重要,我拿著這篇文章默默比對,確實發現我這個文章有不少數據上的欠缺。

[踩坑3:沒有在期刊上尋找完整的數據要求。從這次經歷來看,有些相對成熟的領域,可能會有文章講述過對數據的要求,如果能夠找到這篇文章,對著這個文章一個一個採集數據,那麼可以節約很多的時間,畢竟說不定就因此少拒一次稿了。]

後來補了一部分數據,想不到投啥了,投RSC旗下的F吧。投過去沒幾天建議轉投G,G的話其實比ABCDEF都差……我感覺應該差不多中了吧,然而還沒有。第一波的審稿意見表明,兩個審稿人,一個接,一個拒,意見矛盾,後來送給第三個審稿人,第三個人給的意見是接收。有了第三個人的贊同票,才進入review的階段。

然而事情還沒完。那個拒的審稿意見里其實給了非常多要我補充的內容,然後我玩命去補數據……這段時間我的情緒跌到了谷底,甚至懷疑我是不是真的不適合做學術,越做實驗越覺得自己蠢。補完數據以後,再回復了意見,然後再收到review的意見,我再回復。終於到了第四次,編輯來郵件說文章可以接收了。

大概就經歷了這么個慘痛的過程。怎麼說呢,被不斷拒稿這個事情確實很痛苦,而且會被拒得懷疑人生,可能會連讀博的信心都沒了。然而在看reviewer的comment和不斷回復reviewer意見的過程中,其實我對我所從事的領域的理解有了很明顯的提升,而且補上了很多我原來沒有深入思考然而非常重要的點。除了專業本身以外,對於讀碩讀博這事的想法,包括Aorqu用戶:有哪些東西是你讀研究所以後才懂的?Aorqu用戶:很多人發了很多質量低的文章,這些人搞學術的意義有多大?這兩個回答裡面的觀點,尤其是對於碩博先趕緊發篇小文章再去搞大新聞這類觀點,基本都是在這段跟審稿人拉鋸戰的過程當中形成的。總的來說,這段多次被拒稿的經歷讓我覺得很痛苦,但我自我感覺,我的提升也是非常明顯的。

所以,雖然這么說有點矯情吧,我發自內心感激這段審稿拉鋸戰的經歷。


兔兔:

收到很多醫學生和科研學生的鼓勵和諮詢,受到很大的鼓勵,科研還要繼續做,可能還要出去做,但是臨床也不能丟,每天都要堅持學臨床學病理。畢竟以後上臨床才是最重要的。
最近實驗室有個師姐,一篇12分多的免疫類文章被接受,很受觸動。師姐剛來的時候,大學部讀的不是很好的學校,對科研也是一無所知。但是師姐很堅持,也很鑽研,給我講過自己和審稿人鬥智斗勇的小事情們,可能也影響了我對待成文投稿修回的一些態度。我想,在科研和愛情的一些雞湯是一樣的,不將就,要認真。
^_^ ^_^ 所謂分割線吧 ^_^ ^_^

進入課題組一年左右,開始撰寫自己第一篇第一作者的SCI,從寫到投稿大約一個月左右,幸運的是投稿到本專業一區雜志沒有被拒,大修加resubmit,兩個月修回後小修一天,之後順利接收。接收的那個早晨,和往常一樣六點半起床,準備洗漱早飯去實驗室,打開手機第一件事看到了新郵件,accept這個單詞讓我從床上跳了起來,平靜一分鐘,發給男友父母這個好消息,然後給老闆安靜的發了一個微信說接收了,我能從老闆的回復中感受到他的totally 欣喜。那一刻,滿滿的幸福感和對老闆對自己的感謝。
大約在實驗進行到一半的時候,我好好梳理了一些自己的思路,並且確定了整篇文章的構架。之後就是按照構架一步步往下做。可能是大學部時候英文基礎比較好,參加過一些英語競賽,培訓過幾次,所以寫文章的過程比較順利。組里強大的師兄師姐幫我把握了邏輯問題。講真,我還送到公司修改,但是我覺得沒有什麼用,公司修改的就是一點點的語法和錯誤的單詞什麼的,英語水準還不錯的童鞋可以相信自己一些。投稿前我大約看了文章30多遍,還請我的共一作者幫我看了兩天,確認沒有任何錯誤,終於投稿。我覺得,保證沒有任何錯誤是最起碼的誠意。一篇文章的成文,不能是勉強的拼湊,還是需要完整的邏輯和認真的態度。
我們一區雜志審稿很快,三周之後,某個晚上我就收到了revise and resubmit的通知,這算是大修中的大修了。老闆叮囑我說,這個還是有修回拒稿的可能性,叫我一定認真對待。我用一周的時間仔細分析每一個問題(為什麼分析這么久?因為三個審稿人洋洋灑灑寫了4-6頁的問題,大約需要十幾個實驗回答和上百篇文獻閱讀)。接下來就是瘋狂的補實驗,還聯系了上海的實驗室幫忙做了敲除鼠的實驗,其中的艱辛,哈哈我都要忘掉啦,只是教會我,全力以赴這四個字。我還記得,有一個夜晚,做實驗到十一點半,我男友送我回宿舍,我倆在學校僅有夜宵的食堂吞了一碗餛鈍,竟然也吃得開心的很。最後,每一個問題我都回答了,而且做了很多結果圖,正文也做了非常全面細致的改動,下劃線佔全文80-90%之多。這一次修回的時候,大約PDF版本100多頁,response寫了60多頁,附加文獻100多篇。
再次收到修回通知就知道差不多能中了。但是還是很仔細的進行了一些回復,問題都不那麼棘手了。我覺得可能editor看到了我的誠意,所以特別為難我的一個審稿人就沒再出現了。
從寫文章到投稿1個月左右,從投稿到接收接近4個月。這期間還跨了年,第一次大修上載都是過年的前兩天了,過完年回來就收到小修的通知。當時的喜悅是浸潤在每一天的生活里,拚命的修回,努力的健身,很充實的時光。最後一次上載修回的時候,忙到凌晨4點,人生中第一次熬夜,但是很清醒很不想睡覺。
昨天老闆把當期雜志拿給我,要我好好收藏,人生的第一篇paper。
我不是學霸,但是還是在這個過程中感受到了付出和收穫的喜悅。科研和臨床生活仍在進行,學醫的道路沒有過懶覺和假期,但是不覺得累,只覺得每天都有小收穫,偶爾追劇偶爾看小說,再不能更平凡的生活。
所以,會繼續做下去,做感興趣的方向,學最愛的臨床↖(^ω^)↗


一隻小飛蟲:

粗看了一下,回答這個問題的應該是名校博士居多吧,我把大學部發SCI的經歷用來回答這個問題還是有一點心虛的,希望大家看了能有幫助,否則就當故事看吧。

先說說背景吧,本人環境專業(沒錯,就是Aorqu黑的最狠的環化),目前Phd在讀,兩篇SCI都是大X的時候發的,都是以第一作者,其中一篇在SCI一區的Bioresource Technology 上,另一篇在SCI二區的Biodegradation上,回想起來這兩篇文章能夠發表出去既是努力也是幸運。

故事要從大二暑假開始說起。

一.起因

當時就有想過要出國,而且對本專業也是十分的感興趣,總歸是要走上學術科研之路的。恰逢這時候自己申請的浙江省的一個科研項目通過了,本來是以完成此課題為目的,但是在導師的鼓勵和指導下:要發文章就發英文的。樹立了目標就好辦了,轉變為以發SCI為目的。個性里自帶一種要麼不做,要做就做到最好的性格。都是用時間,為什麼不拼盡全力了

二.沉澱

SCI第一步當然是枯燥的實驗了。最初的時候,只有一個很大的框架,具體的實驗內容和創新點是沒有的。但是對微生物的培養已經開始了,實驗還是一直做著,測每天的水樣。

這個時候的心態相當的重要,當你看到同實驗室的其他成員的實驗做的如火如荼的時候,而你還沒有正式的步入正軌,心裡難免會有一些落差和著急,但是千萬不要放棄也不要抱怨你的課題和不如別人,要記得一句話,天降降大任於斯人也,必先苦其心志勞其筋骨,空乏其身。誰能預想到最後的結果了。

為了尋找突破口,通過導師的指點,和大量的看文獻,以至於我對各個領域的研究都有所了解,另一個意外收穫就是英語水準的提升,特別是學術英語進步神速。

知識儲備到一定後,總有爆發之時。

三.轉機

在最困難的時候,一件小事讓事情有了轉機。一次我經過一個水果店,意外發現其中的一種水果的果皮和我們實驗所要用的常規的材料非常相似,靈機一動,便用起了這一材料,最後才有了BT的這片文章。

事後想想,其實一切的幸運和偶然都是建立在你足夠的知識儲備上。帶著腦子去看前人的文獻和研究很重要。我最初看英文文獻的時候都是列印出來,一段段一句句的看,分析。之後看的多了速度才會有提升。做什麼事,入門是最難的,但是只有坐得住,耐心就可以做到。

實驗持續做了大半年,當時既要上課考試,又要做實驗,還有數據分析和處理,所以基本上都是一下課就跑去實驗室,然後擠著時間分析數據。但這並沒有影響到我的課業成績,當時的分數基本都在90+。

人好像會在越忙的時候,越容易激發潛能和開悟。

大三上半學期結束的時候整個實驗階段已經結束了,然後就是數據分析,再加上我們有一些微生物的樣要拿出去外面測。在等微生物結果的這段時間,一直在分析已有的數據和寫論文。

當時在很短的時間里學會了相當多的數據分析和作圖軟體,SPSS,Origin, Endnot,等。大三的下半學期基本上也是在分析一些數據,當時我是同時做了兩篇論文的實驗,所以論文也是同時寫的。

四.下筆

分享一下我的寫作經驗:

1,寫文章的時候,可以直接用的英文,當然這條因人而異,可能也是因為之前看的都是英文的文獻,所以對我來說好像直接用英文寫會簡單很多。

2,在寫作的過程當中,分析哪一個點的時候或者感覺到困惑的時候,適當停下來,試著去尋找大量相關的文獻去做支撐。

在看文獻的時候一定要記住多摘錄一些專業用語和連接詞等,覺得你可以在你自己文章中以後能用到的都摘錄下來,以及一些新的想法也要分類的摘錄下來,好記性不如爛筆頭。這種方法很能幫你理清思路和將文章寫的更學術化。

當然要寫出一篇高水準的文章,絕對不是看一二十篇文章就可以寫出來的。我當時在寫文章的時候把所有可能的分析都進行了特別深入的研究,當時不加上微生物,文章就達到了1萬多字,導師在修改的時候將很多對文章主幹分析不太重要的部分都建議我刪掉了,但我並沒覺得白白浪費時間精力,恰恰相反,通過這種深入的分析,讓我更深入的去了解整個實驗的運行機理。

五.投稿

大概在大四上學期的時候,當時我正在北京(北京農科院)實習,這時候微生物的分析結果出來了,這部分的分析相當的重要。曾經有一個學妹問我怎麼分析微生物這一塊,我說很簡單,把你微生物檢測結果中出現的主要的屬清出來,然後一個一個分析其功能特性。怎麼分析?其實很簡單,直接檢索這個微生物,和自己文章只要有一丁點相關的都看一下。可以毫不誇張的說,能完成這兩篇文章是基於200+相關文章的瀏覽量,我一般看文章幾乎都是英文的。當然不可能完整的都看完,當看的多了,你就很容易在很短的時間內在一篇文章中找到你想要的東西。

然後就是投稿階段了。開始投稿是在大四的寒假,投稿的整個過程是在導師的指導下自己完成的。BT的那篇文章一次過,投稿後的一個月就過了編輯,然後沒有多久就有了返稿的意見,然後審稿人所提到的問題也沒有太難回答的,修改之後提交就順利發表了。

Biodegradation 那篇稍微曲折一點,第三次才中,其實說實話,我自己有很深的感覺Biodegradation 那篇從introduction 開始就與BT 那篇有很大的差距,都是出自本人之手,為什麼差距這么大?後來仔細分析了一下,因為這兩篇文章是同時寫的,而且在內容上有些是相似的,而我對BT 那篇文章有一定的偏愛,從思路和取材上我都很欣賞,所以看到好的句子和有好的想法,都往BT那篇寫,以至於在BIO那篇就有點被榨乾了的感覺。不過最後結果都是不錯的,Biodegradation 這個期刊也還讓人滿意。

寫在最後

科研之路雖然篳路藍縷,但也很開心。花了很多時間做這一件事情,更多的支撐還是來自興趣。要說收穫吧,大概就是幫我拿下了昆士蘭大學Phd全額獎學金的申請吧。

最後以一直鼓勵自己的一段話作為結尾:

You can』t get rid of fear. It』s like Mother Nature. You can』t beat her or outrun her, but
you can through it. You can find out what you』re made of

你無法擺脫恐懼,它就像大自然你贏不了也逃不了,但只要撐過去,你就會了解你的潛力。

在科研之路上,不可能是一帆風順的,你會遇到各種各樣的困難,但往往困難都是轉機,以樂觀的心態克服它定會收穫意想不到的結果。

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