博士應該採取什麼策略讀文獻?

問題描述:看到兩種相反的觀點: 1、盡可能多讀並整理,全方位了解問題的背景和來龍去脈。 2、盡可能少讀,而且每篇用很短的時間(20 min),只需要提取與課題直接相關的資訊即可,然後直接開始幹活,干不動再找。期間讀盡可能少的文獻了解進展即可(類似於這個:Philip Guo - Opportunistic Paper Reading)。 想知道各位都是怎麼做的。
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Aorqu用戶:
1、剛開始時,0.9A+0.1B
2、進入實驗,0.5A+0.5B
3、發現有意思的,沒聽說過沒見過的現象,0.9A+0.1B
4、驗證上一步自己的想法,0.1A+0.9B
最後兩步循環播放。
其中還有一些可以粗略劃分的階段,得了閑暇再做描述。


Aorqu用戶:
我覺得每個領域應該不太一樣吧,關於泛讀,如果是生物的話,可以在pubmed或者Google scholar 上面設置關鍵詞alert,相關的文獻會發到自己的郵箱。理想狀況下應該也關注自己領域的top journal,定期閱讀,可以用rss訂閱。我最近發現一個app叫做read by QxMD,只限於生物和醫學領域,可以設置關鍵詞以及journal進行閱讀,並且這個軟體有一定的人工智慧,能夠根據你過去閱讀的類型,推薦你可能感興趣的內容。

在這個過程中,我是大多數文章都是只看看摘要一類的掃過去。如果看了之後覺得很感興趣,可以打開原文閱讀。如果跟自己研究非常想關,再細細閱讀。

僅供參考


渠志倍:

現在我最大的感受就是,特喵的壓根就不用看文獻。(建立在你有紮實的知識結構,並且對本領域有一個清晰的認知網路的基礎上。)

至於本領域的最新動態,微信上有那麼多科研公眾號,早上睡醒時候隨手瞄一眼微信就知道個大概了。特別重大的進展和Nature, Science 級別的大paper,你的那麼多熱愛科研的博士生基友他們會在票圈轉發的。

至於做第一流的科研的大老闆們,他們的idea不會是由看文獻冒出來的。他們的科研訴求往往超前又高度集中,文獻里不會有多少可供參考的有價值資訊的。一個科學領域裡面,最重大的難題就擺在那裡,對全世界的科學家都一樣的公平。就看大家有多少本事可以來各顯神通了。

記得施一公院士的一篇流傳甚廣的文章里提到,他在約翰·霍普金斯的結構生物學泰斗老闆不怎麼看最新的文獻。他老闆的原話大概是「我只有在有需要和寫paper的時候才會看文獻。」幾年前中二的我還在和師弟師妹(P.S.主要是師妹)們面前大談特談好好做科研要在研究所頭兩年內看一萬篇文獻。當時的我看到這篇施一公對看文獻的建議,自然是十分不理解。現在我終於感受到了,施一公和施一公的老闆,他們真的是對的(當然是站在他們那個不把一兩篇NCS文章放在眼裡,心裡所想唯有做一流的研究,在學術史和未來的課本教材里萬古留名再順便獲個諾貝爾獎啥的就更棒了的高度上)!

我在此不厚道的猜想一下我現在的金髮碧眼大老闆是怎麼「看」文獻的。他大概最主要的文獻通道有兩條:一是參加各種學術大會,會上打起精神勉為其難聽一下可以勾起自己一丟丟興趣的大會報告,報告過後再找一同被邀請參會的大牛們social一下談笑風生,晚上參加個晚宴啥的觥籌交錯吹吹牛逼(不好意思,我忘記了我老闆已經戒酒快兩年了,但觥籌交錯講的是個氣氛。。),然後在燭影搖紅下一個個idea就應運而生了。第二個文獻通道是審稿。老闆是本領域某一知名學術期刊的副主編,在沒有聘用秘書的情況下,面對熱門期刊的海量投稿,老闆也只能狂灌咖啡硬著頭皮啃,你們投稿的一封封據信就是這么來的。老闆鑒於其影響力,又是某學術領域裡面投N字頭paper繞不過去的審稿人。換言之,本領域最新的頂級工作,十有八九會落到我老闆手裡審稿,老闆就是這樣地具有優先權可以享用到先於期刊發表周期數月的學術最前沿工作。

之前我在大陸的時候,大小老闆都經常和我們提做科研的時效性。他們的所謂時效性,大概是和文章檔次呈正比的。Nature, Science 上的文章時效性最強,是最需要和時間賽跑搶在競爭者前面發paper的;其次是Nature Chem., JACS 這樣的專業top期刊;再往下就是二區三區了。之前年幼的我對此深以為然,但現在想想看,他們也許是混淆了時效性和創新性這兩個概念。

後來有幸來到了可以發Nature, Science 的所謂牛組裡面,才知道原來根本不是這么回事兒。真正的Nature, Science 級別的大paper,哪一篇不是在組里折騰個四五年才發出去的?我剛得知這一事實之後驚呆了,覺得老闆就是神人。按照我以往的理解,在頂級期刊(Nature, Science)上發表的必定是當下最創新最好最牛逼最具時效性的工作;而一個工作在做個四五年之後可以發最好的頂級期刊,這意味著老闆當時在選定課題時,眼光超前整個學術界四五年。這需要何等的眼界和視野才可以做得到!

縱觀我們組的大paper的特點,一向是物理圖像簡明清晰,理論部分紮實充分。這當然和我老闆是前蘇聯莫斯科國立出身,而且老媽是搞物理的息息相關。我每次閱讀這些paper時候,都會倒吸一口涼氣,一是感嘆老闆太能扯了,什麼樣的應用拓展都敢展望;二就是感嘆文章理論工作做的遠較一般論文來得紮實,十分體現老闆深厚的數理功底。

我們課題組劃歸在化學工程系(Chemical Engineering),組里主要是做納米材料的。在這一實驗作為絕對主導的領域里,各個尺度下的理論模型其實都已經日趨完善。在簡單分子尺度,可以做 ab initio 從頭算;體系再大一些有 QM/MM 和半經驗方法;再大一些有分子動力學MD;MD 跑不動的體系,可以做基於有限元方法的數值計算(eg. FDTD)。實驗上發現的新結構、新現象,如果需要理論模型,在科學研究的意義上已經可以做到神擋殺神,佛擋殺佛。理論模擬和計算,本地工作站可以做的,自己跑;工作站跑不動的,學校里有超級計算平台;組里可以做的組里自己做,組里做不了的體系,系裡有幾個純做計算的PI,都滿心歡喜等著和老闆合作發雙通訊paper呢;自己學校裡面做不了的體系,老闆大概幾個電話或幾封郵件,也是可以搞定合作的。

所以,老闆在給組里民工們選課題時,壓根就不太考慮會不會有別的組也做類似的課題。這一來是兩個獨立的課題組在沒有商量的情況下,幾乎不可能把體系做的一模一樣。就算核心idea完全相同,在不同的組里也是會做出不一樣的東西出來。二來是,就算別的組先做了一些類似的東西出來,其工作的系統性,理論工作的完整性都不大會高於我們。我們拾掇拾掇還是可以把文章發的更高。組里發的上一篇 Nature 就是這樣,且不說我們組就在兩年前在《先進功能材料》(Adv. Funct. Mater.)有一篇類似的研究報道。而且在這篇 Nature 投稿期間,就有一篇文章做了幾乎一模一樣的納米結構發在了 Langmuir;而且說實話,那篇Langmuir 做的結構形貌比我們的還要更漂亮一些。但老闆仍然以其牛X的理論高度成功沖擊了 Nature

最後,希望大家在學術生涯早期(博士生和博後階段)能夠盡量將眼光放長遠,不要過分拘泥駐足於點滴的細節,不要妨礙於無關緊要的雕蟲小技,多一些全局把握。這樣到我們成為PI獨立開展工作的時候,才可以遊刃有餘,成為第一流的研究學者。


李艾藍:

哥我大學都沒畢業你邀請我


Pjer:

基本策略:

【-】為選題而讀文獻—>廣度優先遍歷

【-】為研究而讀文獻—>深度優先遍歷

選題讀文獻:在還沒有確定的課題方向的時候,這個時候只有個大方向,可能已經上過幾門導論課,僅僅知道學科內大致有哪些研究方向,挑選了自己喜歡的方向。或者導師給的是一個開放命題,沒有一個預期的研究成果。

這個時候讀文獻的目的是盡可能多的了解方向內都有什麼代表性的成果,可以給自己提供一些思路和切入點。

這個時候需要廣度優先遍歷,讓視野盡可能廣,保證這一波讀文獻之後業內有哪些大佬,大致做哪些方向都一清二楚,在讀文獻的時候要下意識去尋找相似文獻,例如下圖researchgate上的文章下面都會有推薦閱讀,這種推薦在mendeley等這些讀文獻軟體里也會有。看看做過相似工作的人都有哪些,都是用什麼方法實現的。

這個時候需要避免的情況就是看到一個文獻的一個小部分引用了若干之前的文獻,之前的文獻又引了更之前的文獻。

這部分讀文獻的目的是impression,所以只需要明白「What it is」即可。搞明白「How it works」是下一步的工作。

研究讀文獻:這時候的目的就是”How it works”

比如我所在的空間物理領域,大家找文獻一般都是在

https://ui.adsabs.harvard.edu/​ui.adsabs.harvard.edu

可以很輕易的通過標題或作者或年份找到文章,【在研究過程中,首先要參考的還是這個選題方向下的經典工作,被大家廣泛接受和認同的】

找到文章之後自習閱讀文章,這個時候就是精讀,要吃透「How it works」,這就需要在讀的時候,遇到他在敘述方法的時候引用其他文章的時候追進引用,完全弄明白其原理。在讀完這一篇之後,因為這是經典之作所以引用量很大,要看看這一篇是被哪些引用,有多少是最近的工作,最好是能找到最近相關度高的科研成果。

所以深度優先遍歷的關鍵是這兩個鍵:Citations Reference。看他引用的和引用他的文章,這樣可以最快速度的摸清這個研究方法或者研究內容楚來龍去脈。並在一定程度上掌握這些內容,後續應用到自己的科研中去。

當然最終結果,不管是廣度優先還是深度優先,目的都是遍歷,也就是盡可能多的讀文章,一方面可以提高自己的姿勢水準,另一方面也可以避免遇到工作做完了,寫了文章投出去了,結果審稿人一封拒信告訴你【這個幾年前就有人做出來了】這種尷尬局面。

要說看文章還是平常多積累的事情,手機上可以把和學術無關(微博抖音什麼的)卸了,裝個ResearchGate【 Pjer:ResearchGate:優雅的科研社交 】。平常以刷新聞看八卦的姿態去看最近的科研動向,這樣在來新課題的時候就會已經有impression了,就可以直接上手做了。

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